Aqui el codigo
var emptyCells = { items: "" };//creamos un objeto con items vacios
var emptyStore = new dojo.data.ItemFileWriteStore({data: emptyCells});
this.myGridname.dojoObj.setStore(emptyStore);//aplicamos solo sobre el objeto dojo del grid
Espero que les sirva.
Fuente: http://jadendreamer.wordpress.com/2011/03/07/dojo-tutorial-clear-all-data-from-the-grid/
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